任天堂已經為《超級瑪利歐 3D收藏輯》發布了版本 1.1.0 更新，玩家們可以免費下載囉。添加的功能包括有針對全3部作品的鏡頭控制，關於任天堂 GameCube 控制器使用的支援，以及一些一般修復。你可以從下方找到完整的補丁筆記：
版本 1.1.0 （2020年11月16日釋出）
一般：
●現在玩家們可以在全3款個別遊戲當中反轉鏡頭控制
●《超級瑪利歐陽光》現在支援 GameCube 控制器的使用（控制器另外販售）。玩家現在可以使用與原始GameCube版本中相同的控制來遊玩本作品。
-任天堂 GameCube控制器在《超級瑪利歐陽光》當中的使用僅有在電視模式當中獲得支援。
- 你會需要 GameCube 控制器轉接器（另售）才能在任天堂 Switch系統上使用此控制器。可以在此處找到有關轉接器與控制器的相關資訊。
- 任天堂 Switch Lite 系統不支援這個控制器選項。
- 所有《超級瑪利歐陽光》當中的按鈕配置並不會映射到任天堂 GameCube 控制器上。
- 其他的一般性修復已被用於改善全三款遊戲的玩法。